代理記賬處理企業(yè)年末結(jié)賬的流程一般如下：

1. 收集并核對企業(yè)全年的各項會計憑證和資料，確保全部準確無誤。

2. 按照財務(wù)制度和會計政策，生成全年的財務(wù)報表，包括資產(chǎn)負債表、利潤表、現(xiàn)金流量表等，并在報表上填寫審核人姓名和日期。

3. 審查會計檔案，查看是否存在漏項和錯誤，并且對異常情況進行調(diào)整處理。例如：對于壞賬、存貨跌價以及長期待攤費用等情況需要進行計提或者沖銷。

4. 對利潤進行所得稅清算，確認稅款繳納金額。

5. 對企業(yè)所有銀行賬戶進行核對，確保各項賬務(wù)正確無誤，同時填寫銀行對賬單。

6. 編制年終分錄，并在會計系統(tǒng)中進行錄入和審核。

7. 確認各項報表的準確性和完整性，提交相關(guān)部門審核，并存檔備查。

總之，代理記賬在處理企業(yè)年末結(jié)賬的過程中，需要對企業(yè)全年的會計憑證和資料進行詳盡收集和核對，對各種涉及到的復(fù)雜情況進行認真處理。最后，要在審核無誤后生成各項財務(wù)報表并確認其準確和完整性，并提交相關(guān)部門審核，確保符合相關(guān)法規(guī)和會計準則。